Protein–RNA interactions for Protein: P23634

ATP2B4, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B4P23634 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATP2B4P23634 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms