Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PTPRBP23467 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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