Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
NR4A1P22736 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms