Protein–RNA interactions for Protein: P22415

USF1, Upstream stimulatory factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF1P22415 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
USF1P22415 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
USF1P22415 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
USF1P22415 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
USF1P22415 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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