Protein–RNA interactions for Protein: P20823

HNF1A, Hepatocyte nuclear factor 1-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF1AP20823 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
HNF1AP20823 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HNF1AP20823 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms