Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SDSP20132 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SDSP20132 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SDSP20132 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SDSP20132 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms