Protein–RNA interactions for Protein: P16144

ITGB4, Integrin beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4P16144 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITGB4P16144 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ITGB4P16144 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms