Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HOXB3P14651 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms