Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
GTF2F2P13984 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
GTF2F2P13984 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms