Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CD8BP10966 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD8BP10966 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD8BP10966 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD8BP10966 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD8BP10966 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CD8BP10966 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms