Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
MCF2P10911 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
MCF2P10911 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
MCF2P10911 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
MCF2P10911 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms