Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RGPD2P0DJD1 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RGPD2P0DJD1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms