Protein–RNA interactions for Protein: P09067

HOXB5, Homeobox protein Hox-B5, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB5P09067 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
HOXB5P09067 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HOXB5P09067 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms