Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NEFLP07196 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NEFLP07196 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NEFLP07196 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NEFLP07196 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms