Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SPTA1P02549 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms