Protein–RNA interactions for Protein: O75936

BBOX1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBOX1O75936 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BBOX1O75936 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BBOX1O75936 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms