Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SKAP2O75563 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms