Protein–RNA interactions for Protein: O75154

RAB11FIP3, Rab11 family-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP3O75154 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAB11FIP3O75154 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB11FIP3O75154 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms