Protein–RNA interactions for Protein: O43765

SGTA, Small glutamine-rich tetratricopeptide repeat-containing protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGTAO43765 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGTAO43765 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGTAO43765 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGTAO43765 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SGTAO43765 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SGTAO43765 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SGTAO43765 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SGTAO43765 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGTAO43765 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGTAO43765 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGTAO43765 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGTAO43765 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SGTAO43765 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms