Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LRRTM2O43300 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LRRTM2O43300 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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