Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CRXO43186 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CRXO43186 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CRXO43186 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
CRXO43186 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms