Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
POLR1CO15160 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
POLR1CO15160 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms