Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
USP9YO00507 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
USP9YO00507 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
USP9YO00507 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
USP9YO00507 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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