Protein–RNA interactions for Protein: D6REC4

CFAP99, Cilia- and flagella-associated protein 99, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP99D6REC4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CFAP99D6REC4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms