Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
USP17L12C9JPN9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms