Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
CLDN25C9JDP6 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms