Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMIM1B2RUZ4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMIM1B2RUZ4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
SMIM1B2RUZ4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SMIM1B2RUZ4 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms