Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SRRM4A7MD48 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
SRRM4A7MD48 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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