Protein–RNA interactions for Protein: A6NH21

SERINC4, Serine incorporator 4, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC4A6NH21 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SERINC4A6NH21 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms