Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PALM3A6NDB9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PALM3A6NDB9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms