Protein–RNA interactions for Protein: A5PKW4

PSD, PH and SEC7 domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSDA5PKW4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PSDA5PKW4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PSDA5PKW4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms