Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5T5

USP16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP16Q9Y5T5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
USP16Q9Y5T5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
USP16Q9Y5T5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms