Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GTF3C3Q9Y5Q9 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms