Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5I7

CLDN16, Claudin-16, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN16Q9Y5I7 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CLDN16Q9Y5I7 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms