Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2N7

HIF3A, Hypoxia-inducible factor 3-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF3AQ9Y2N7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
HIF3AQ9Y2N7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
HIF3AQ9Y2N7 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms