Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L5

TRAPPC8, Trafficking protein particle complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8Q9Y2L5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TRAPPC8Q9Y2L5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms