Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ88

CDK11A, Cyclin-dependent kinase 11A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11AQ9UQ88 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
CDK11AQ9UQ88 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CDK11AQ9UQ88 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms