Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
L1RE1Q9UN81 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
L1RE1Q9UN81 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms