Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL33

TRAPPC2L, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2LQ9UL33 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TRAPPC2LQ9UL33 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRAPPC2LQ9UL33 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms