Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
MRTO4Q9UKD2 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MRTO4Q9UKD2 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms