Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SFMBT1Q9UHJ3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms