Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CHORDC1Q9UHD1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms