Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MLH3Q9UHC1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms