Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NIPSNAP3AQ9UFN0 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NIPSNAP3AQ9UFN0 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms