Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
VTI1BQ9UEU0 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
VTI1BQ9UEU0 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms