Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY5

LPAR3, Lysophosphatidic acid receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR3Q9UBY5 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LPAR3Q9UBY5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms