Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CTSFQ9UBX1 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTSFQ9UBX1 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms