Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT3

DKK4, Dickkopf-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK4Q9UBT3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DKK4Q9UBT3 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms