Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
XCL2Q9UBD3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
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