Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J3

KLHL9, Kelch-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL9Q9P2J3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
KLHL9Q9P2J3 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL9Q9P2J3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms